De invoerfile die verwerkt wordt door EdoDocGen kan geback-upt worden. Hiervoor moet in de config file van EdoDocGen een parameter met de gewenst back-up directory toegevoegd worden. De config file is EDODocGen.exe.config. De parameter staat in AppSettings en is:

<add key="BackupDir" value="&lt;directorynaam&gt;">

Als de parameter ontbreekt of de waarde is een lege string, dan wordt er geen back-up uitgevoerd. Bestaat de ingevoerde directory niet, dan volgt bij het opstarten van EdoDocGen een foutmelding. Het back-uppen zal alleen lukken als de gebruiker waaronder EdoDocMon (de service die EdoDocGen opstart) draait, schrijfrechten heeft in de opgegeven directory. Als het back-uppen van de file mislukt, dan wordt dit via een waarschuwing in het log gemeld. De invoerfile wordt in dat geval wel verwerkt.